本文采用機器學習的方法，研究了蛋白質(zhì)相互作用和功能預測的幾個重要方面：蛋白質(zhì)相互作用位點預測、蛋白質(zhì)相互作用能量熱點(Hot Spots)預測、蛋白質(zhì)相互作用預測和蛋白質(zhì)功能預測。提出了一系列的蛋白質(zhì)相互作用及功能預測方法。