化學(xué)信息學(xué)(翟紅林)(第二版)
定 價(jià):42 元
- 作者:翟紅林 主編
- 出版時(shí)間:2025/8/1
- ISBN:9787122471369
- 出 版 社:化學(xué)工業(yè)出版社
- 中圖法分類(lèi):G254.97
- 頁(yè)碼:234
- 紙張:
- 版次:02
- 開(kāi)本:16開(kāi)
《化學(xué)信息學(xué)》是為大學(xué)本科生而編寫(xiě)的化學(xué)信息學(xué)教材,共分為6章:第1章介紹了化學(xué)信息學(xué)基礎(chǔ),內(nèi)容主要包括化學(xué)信息學(xué)的產(chǎn)生與發(fā)展、基本概念、研究?jī)?nèi)容與方法及其與實(shí)驗(yàn)科學(xué)的關(guān)系,人工智能技術(shù)在化學(xué)中的應(yīng)用簡(jiǎn)介;第2章介紹了化學(xué)結(jié)構(gòu)的計(jì)算機(jī)表示方法與特點(diǎn)、SMILES編碼與MOL格式文件、化學(xué)軟件ChemOffice與HyperChem的使用;第3章重點(diǎn)講述了基于網(wǎng)絡(luò)資源的化學(xué)文獻(xiàn)檢索方法與技巧、重要數(shù)據(jù)庫(kù)與學(xué)術(shù)期刊,文獻(xiàn)管理軟件EndNote的使用;第4章介紹了基本數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與回歸建模分析、機(jī)器學(xué)習(xí)與深度學(xué)習(xí)及其實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)介;第5章介紹了正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)與均勻試驗(yàn)設(shè)計(jì)等;第6章主要介紹了分子力學(xué)與分子模擬初步。
《化學(xué)信息學(xué)》可作為高等學(xué);瘜W(xué)、化工、材料、生物、環(huán)境等相關(guān)專(zhuān)業(yè)本科生化學(xué)信息學(xué)課程的基礎(chǔ)教材。由于所涉及內(nèi)容、技術(shù)與方法等具有一定的普適性,本書(shū)也可作為相關(guān)領(lǐng)域科研人員和研究生的參考用書(shū)。
翟紅林,蘭州大學(xué),教授、博士生導(dǎo)師。 1986年6月蘭州大學(xué)化學(xué)系物理化學(xué)本科專(zhuān)業(yè)畢業(yè)獲學(xué)士學(xué)位并留校工作至今。2004年12月獲蘭州大學(xué)分析化學(xué)博士學(xué)位,2007年1月至2008年1月赴臺(tái)灣長(zhǎng)庚大學(xué)分子醫(yī)學(xué)研究中心開(kāi)展抗癌藥物設(shè)計(jì)及癌癥早期診斷的博士后研究工作。專(zhuān)業(yè)特長(zhǎng)為數(shù)據(jù)建模與分析、程序設(shè)計(jì)與應(yīng)用;目前主要從事復(fù)雜體系中的多組分同時(shí)定性與定量分析、實(shí)驗(yàn)條件優(yōu)化、分子模擬與藥物分子設(shè)計(jì)的化學(xué)與生物信息學(xué)及其在相關(guān)領(lǐng)域中應(yīng)用的教學(xué)與科研工作。已在TrAC-TrendsinAnalyticalChemistry、Analyst、AnalyticaChimicaActa、FoodChemistry、J.ChromatographyA、Talanta、J.SeparationScience、J.ChemicalInformationandModeling、ChemometricsandIntelligentLaboratorySystems、ChemicalBiology&DrugDesign、ComputationalBiology&Chemistry等國(guó)內(nèi)外學(xué)術(shù)期刊上發(fā)表研究論文六十余篇;已主持并完成國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目及多項(xiàng)校企橫向課題。
第1章緒論1
本章要點(diǎn)1
1.1信息與信息學(xué)1
1.1.1信息1
1.1.2信息學(xué)2
1.2化學(xué)信息與化學(xué)信息學(xué)3
1.2.1化學(xué)信息3
1.2.2化學(xué)信息學(xué)的產(chǎn)生與發(fā)展5
1.3化學(xué)研究與人工智能8
1.3.1科學(xué)研究范式與人工智能8
1.3.2化學(xué)人工智能9
1.4化學(xué)信息學(xué)與實(shí)驗(yàn)科學(xué)的關(guān)系11
1.5關(guān)于本教材12
思考與練習(xí)12
參考文獻(xiàn)與擴(kuò)展閱讀12
第2章化學(xué)結(jié)構(gòu)的計(jì)算機(jī)表示14
本章要點(diǎn)14
2.1化學(xué)結(jié)構(gòu)的表示14
2.1.1化學(xué)結(jié)構(gòu)的一般表示及其特點(diǎn)14
2.1.2化學(xué)結(jié)構(gòu)的計(jì)算機(jī)表示方法15
2.2SMILES編碼17
2.2.1SMILES基本編碼17
2.2.2SMILES擴(kuò)展編碼19
2.3其他線(xiàn)性編碼20
2.3.1SLN編碼20
2.3.2ROSDAL編碼20
2.3.3InChI標(biāo)識(shí)與InChIKey21
2.4化學(xué)結(jié)構(gòu)的二維表示及格式文件22
2.4.1連接表22
2.4.2格式文件23
2.5化學(xué)結(jié)構(gòu)的計(jì)算機(jī)處理26
2.5.1化學(xué)結(jié)構(gòu)的計(jì)算機(jī)輸入與可視化26
2.5.2ChemOffice/ChemBioOffice簡(jiǎn)介29
2.5.3HyperChem簡(jiǎn)介39
思考與練習(xí)44
參考文獻(xiàn)與擴(kuò)展閱讀48
第3章化學(xué)文獻(xiàn)檢索與管理50
本章要點(diǎn)50
3.1文獻(xiàn)基礎(chǔ)知識(shí)50
3.1.1文獻(xiàn)檢索的意義50
3.1.2科技文獻(xiàn)的類(lèi)型及其特點(diǎn)51
3.1.3重要的文獻(xiàn)源51
3.1.4科技文獻(xiàn)檢索方法與途徑53
3.2美國(guó)化學(xué)文摘(CA)55
3.2.1CA概況55
3.2.2SciFinder數(shù)據(jù)庫(kù)56
3.3科學(xué)引文索引與工程索引65
3.3.1科學(xué)引文索引(SCI)65
3.3.2Web of Science68
3.3.3工程索引(EI)78
3.4ScienceDirect與Reaxys數(shù)據(jù)庫(kù)80
3.4.1ScienceDirect數(shù)據(jù)庫(kù)80
3.4.2Reaxys數(shù)據(jù)庫(kù)81
3.5中文文獻(xiàn)檢索簡(jiǎn)介87
3.5.1概述87
3.5.2中國(guó)知網(wǎng)87
3.6搜索引擎檢索92
3.7重要學(xué)術(shù)期刊簡(jiǎn)介93
3.7.1電子期刊的興起93
3.7.2綜合性期刊94
3.7.3常見(jiàn)的化學(xué)化工類(lèi)期刊94
3.8文獻(xiàn)管理軟件96
3.8.1文獻(xiàn)管理與軟件96
3.8.2EndNote簡(jiǎn)介97
思考與練習(xí)105
參考文獻(xiàn)與擴(kuò)展閱讀105
第4章常用數(shù)據(jù)處理方法107
本章要點(diǎn)107
4.1化學(xué)計(jì)量學(xué)簡(jiǎn)介107
4.1.1計(jì)量與計(jì)量學(xué)107
4.1.2化學(xué)計(jì)量學(xué)的基本內(nèi)涵108
4.2化學(xué)數(shù)據(jù)的預(yù)處理109
4.2.1化學(xué)數(shù)據(jù)的基本特點(diǎn)109
4.2.2化學(xué)數(shù)據(jù)的基本描述110
4.2.3化學(xué)數(shù)據(jù)常用的預(yù)處理方法117
4.3線(xiàn)性回歸123
4.3.1回歸模型與最小二乘法123
4.3.2多元線(xiàn)性回歸分析126
4.4主成分分析與因子分析135
4.4.1主成分分析135
4.4.2因子分析139
4.5偏最小二乘分析及其應(yīng)用143
4.6深度學(xué)習(xí)與人工智能建模簡(jiǎn)介146
4.6.1機(jī)器學(xué)習(xí)與人工智能建模的發(fā)展146
4.6.2人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)與機(jī)器學(xué)習(xí)基礎(chǔ)147
4.6.3深度學(xué)習(xí)建模的實(shí)現(xiàn)150
思考與練習(xí)150
參考文獻(xiàn)與擴(kuò)展閱讀152
第5章試驗(yàn)設(shè)計(jì)與優(yōu)化153
本章要點(diǎn)153
5.1試驗(yàn)設(shè)計(jì)基礎(chǔ)153
5.2單因素優(yōu)選法155
5.2.1均分法與對(duì)分法155
5.2.2黃金分割法155
5.2.3分?jǐn)?shù)法(斐波那契數(shù)列法)156
5.2.4其他方法介紹157
5.3正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)158
5.3.1正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)基礎(chǔ)158
5.3.2正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)的直觀分析法162
5.3.3正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)的方差分析法169
5.4均勻試驗(yàn)設(shè)計(jì)173
5.4.1均勻試驗(yàn)設(shè)計(jì)基礎(chǔ)173
5.4.2均勻試驗(yàn)設(shè)計(jì)方法174
思考與練習(xí)178
參考文獻(xiàn)與擴(kuò)展閱讀179
第6章分子力學(xué)與分子模擬180
本章要點(diǎn)180
6.1分子模擬方法概述180
6.2分子力學(xué)理論基礎(chǔ)181
6.2.1分子力學(xué)的產(chǎn)生與發(fā)展181
6.2.2分子力學(xué)的基本假定182
6.2.3分子力場(chǎng)構(gòu)成183
6.3分子力學(xué)勢(shì)能函數(shù)及力場(chǎng)參數(shù)化183
6.3.1鍵伸縮能183
6.3.2鍵角彎曲能186
6.3.3二面角扭曲轉(zhuǎn)動(dòng)能187
6.3.4范德華相互作用能188
6.3.5靜電相互作用能189
6.3.6交叉項(xiàng)189
6.3.7分子力場(chǎng)參數(shù)化190
6.4常見(jiàn)的分子力場(chǎng)191
6.4.1常見(jiàn)的分子力場(chǎng)介紹191
6.4.2常見(jiàn)分子力場(chǎng)的選擇192
6.4.3分子力場(chǎng)存在的問(wèn)題192
6.5分子力學(xué)與量子力學(xué)的比較193
6.6分子力場(chǎng)應(yīng)用193
6.6.1分子結(jié)構(gòu)的優(yōu)化194
6.6.2分子對(duì)接206
6.6.3分子動(dòng)力學(xué)模擬209
6.7Schrdinger功能及分子對(duì)接簡(jiǎn)介214
6.7.1Schrdinger功能簡(jiǎn)介214
6.7.2Schrdinger中的分子對(duì)接簡(jiǎn)介215
6.8分子力學(xué)發(fā)展趨勢(shì)225
思考與練習(xí)230
參考文獻(xiàn)與擴(kuò)展閱讀231
附錄233
附錄1格魯布斯(Grubbs)臨界值表233
附錄2Q檢驗(yàn)臨界值表233
附錄3t檢驗(yàn)臨界值表234
附錄4F檢驗(yàn)臨界值表234